Kegiatan berkebun adalah salah satu kegiatan di Sekolah Imaculata yang memberikan banyak manfaat. Selain melatih motorik kasar dan halus, anak-anak juga didekatkan dengan alam. Melalui kegiatan ini anak-anak dapat memahami tekstur tanah, daun, batang, dan bunga.
Selain itu, anak-anak juga dilatih untuk menyayangi tanaman dan mencintai alam. Dimana kegiatan ini dapat menumbuhkan kecerdasan naturalistik anak.